X-tile-软件的操作流程电子教案

X-tle-软件
流程
操作i的

X－tile 软件的操作流程

由于 最近在做某基因表达与预后相关性的分析，对如何选择最佳cutoff
值很疑惑。搜了丁香园的各大帖 子，发现对x-tile如何使用并没有人分享
过。经过对照软件中的操作说明，终于搞明白是怎么回事 了，现分享给大
家！
首先，将你excel表格中的“某基因的表达值”“生存期 ”“删失情
况”等等其他一些数据复制到文本文档中。注意：“删失情况”要写成
“censo red”, “uncensored”, or “unknown” 形式。
然后打开软件（软件下载见附件），如图
点击“Analyze进入下图：

点击
“file打开刚建的“txt”文本，接着就可以进行设置了。如下图

扩大来看！（下图）
将“删失情况” 即图中的DOD- censor,放入”censor”中， 然后将“inter
type” 改为”DeadOfDiese”；
将“生存期”即图中的”Followup- months”放入“Survival Time”,j将“inter
type” 改为你所用的时间度量，如“天”或“年”；
将“表达量”即图中的”HER2”放入“Marker1”, Mark2如果没有可以不
填。剩余的也可以不填。

然后点左上角的“do”，选择”Kaplan- Meier”—“Marker1”.即可。

接着会出现下如图所示结果。鼠标左键点击“2Pop X-tile Plot”所指的矩形
图，软件会自动找到最佳的cutoff值，得到两条线（两组：高表达－低表
达）。鼠标左键点击“3 Pop X-tile Plot”所指的三角形，软件会自动找到最
佳的cutoff值，得到三条线 （三组：高表达－中度表达－低表达）。
条形图下的X轴所指的数值即是最佳cutoff值。


其余可以参照软件里的指南。

写的比较业余，希望能够给大家一些帮助。