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一、翻译并解释名词:
(10x4
分
)
1.
allele
等位基因
一个位点的序列变异。
2.
Effective
population size (Ne)
有效种群大小
在一个具有相等性比、
随机交配的理想种群中表现出与特定统计
(全部成体
数目)规模相对应的真实的种群杂合性随时间丧失的
速率相同的个体数。
3.
F-statistics F
统计检验
用于评估个体间、
亚种群间和整个种群间杂合性的分布的统计方法,
被广泛
应用于定量亚种群的遗传分化。
4.
Genetic load
遗传负荷
相对于理论最佳值来说降低了的基因型适合度。
5.
Hardy-Weiberg
equilibrium
哈温平衡
当
所有等位基因频率是已知的时候,
在一个大的随机交配种群中的纯合子
< br>和杂合子的预期比例。
假设没有迁移、
突变或选择作用,
哈温平衡定律则认为等
位基因频率从一个世代到下一个世代应该
保持不变。
6.
Bottleneck
effect
瓶颈效应
种群的规模大为缩小,随后常常有一个(种群的)恢复。
7.
Selection
sweep
选择扫荡。
课件:
Occurrence
of
a
beneficial
mutation
,
Only
individuals
carrying
the
mutation
repr
oduce
,
‘Population
bottleneck’,
Mainly
affects
linked
loci
。
8.
IAM
无限等位基因模型
其中突变不是以可
预料的方式一个接一个发生,而大多数突变是像产生
SNP
(单
核苷酸多态性)那样出现的。
9.
Linkage disequilibrium (LD)
连锁不平衡。
术语表:
Linkage
equilibrium
连锁平衡:由重组促成的情形,其中遗传位点在
繁殖期相互独立分离。
当两个位点上的等位基因一起分离时,
如他们在同一个染
色体上的物理位置太接近时,则发生不平衡。
百度:
连锁平衡:
HLA
不同基因座位的各
等位基因在人群中以一定的频率出现。
在某一群体中,
不同座位
上某两个等位基因出现在同一条染色体上的频率高于预
期的随机频率的现象,
称连锁不平衡
(linkage
disequilibrium)
。
由于
HLA
不
同基因座位的某些等位基因经常连锁在一起遗传,
而连锁
的基因并非完全随机地
组成单体型,
有些基因总是较多地在一起
出现,
致使某些单体型在群体中呈现较
高的频率,从而引起连锁
不平衡。
10.
< br>Metapopulation
复合种群
种群再分为多个同类群,至少其中的一些偶尔灭绝,随后通过从其他同类
群迁
入再建立种群。
11.
Microsatellite
微卫星
带有单序列(通常为
2-
,
3-
或
4-
核苷酸)重复
多次的遗传位点。
12.
MtDNA
线粒体
DNA
存在于线粒体中的环状染色体。
13.
Non-synomous
mutation
非同义突变
由一个三联密码变化使特定氨基酸改变的突变。
14.
PCR
聚合酶链式反应
用寡核苷酸引物和耐热的
DNA
聚合酶扩增大量
p>
DNA
序列的一种方法。
15.
SNP
单核苷酸多态性
在
DNA
序列中一个特殊位点上出现不同核苷酸碱基
的等位基因。
16.
RFLP
限制性片段长度多态性
p>
用限制性酶和凝胶电泳鉴定
DNA
序列多态
性的方法。
17.
Transition
转换
一个嘌呤核苷酸被另一个嘌呤核苷酸替代,或一个嘧啶核
苷酸被另一个
嘧啶核苷酸取代的突变。
18.
Transversion
颠换
一个嘌呤核苷酸被另一个嘧啶核苷酸取代或相反过程的突变。
19.
Molecular
ecology
分子生态学
课件
p>
:
分子生物学是应用分子生物学的原理和方法来研究生命系统与环境
系统相互作用的生态机理及其分子机制的科学。
它是生态学与分
子生物学相互渗
透而形成的一门新兴交叉学科
,
其研究内容包括种群在分子水平的遗传多样性及
遗传结构,
生物器官变异的分子机制、
生物体内有机大分子对环境因子变化的响
应、
生物大分子结构、
功能演变与环境长期变化的关系
以及其它生命层次生态现
象的分子机理等。
分子生态学的理论和
方法对传统学科有巨大的促进作用,
同时,
对解决诸如转基因、
克隆技术应用中的生态安全、
环境与人类健康等重大问题将
p>
产生深刻的影响。
20.
Functional
ecological and evolutionary
genomics(FEEG)
生态和进化基因组学??
21.
Phylogeographic
Phylogeographiy
亲缘地理学
研究调控系谱世系的地理分布的原理和过程的科学。
22.
Monophyly
单系
类
群中的所有个体是从同一个祖先来的,
并且从这个祖先来的所有存活
的后代都在这个类群中。
23.
Intron
内含子
真核生物的结构基因间的非编码
DN
A
序列。
内含子被转录但它们的
RNA
拷贝在功能产生期间被切除。
24.
Introgression
渐渗杂交
等位基因从一个种群或物种向另一个种群或者物种的扩散,
而产生像种
群间或物种间的近交或杂交这样的结果。
25.
Genetic drift
遗传漂变
《生物多样性导论》
:在有性生殖的群体中,每个世代的基因库是对上
一个世代基因库的随机抽样和复制。
在世代交替过程中,
不同的等位基因遗传到
下一代的偶然性对种群遗传结构有可能产生显著影响。
Wright
把这种由于配子
产生及
结合过程中的随机性导致的基因频率的波动称为遗传漂变
(genetic
drift)
,也称随机漂变、遗传偏离或
Wri
ght
效应。
26.
Haplotype
单(倍体)型
源于同一染色体或染色体单倍体组的一套等位基因。
27.
ESU(Evolutionary Significant Unit)
进化显著单元
分类学上对保护重要类群的一种尝试性定义。
28.
Metagenomics
宏基因组学
百度:
宏基因组学(
Metagenomics
)又叫微生物环境基因组学、元基因组学。
它通过直接从环境样品中提取全部微生物的
DNA,
构建宏基因组文库,利用基因
组学的研究策略研究环境样品所包含的全部微生物的遗
传组成及其群落功能。
它
是在微生物基因组学的基础上发展起来
的一种研究微生物多样性、
开发新的生理
活性物质(或获得新基
因)的新理念和新方法。其主要含义是:
对特定环境中
全部为生物的总
DNA
(也称宏基因组,
p>
metagenomic
)进行克隆,并通过构建宏
基因组文库和筛选等手段获得新的生理活性物质;或者根据
rDNA
数据库设计引
物,通过系统学分析获得该环境中微生物的遗传多样性和分子
生态学信息。
29.
CpDNA
叶绿体
DNA
存在于叶绿体内的环状染色体。
30.
Heterosis
杂种优势,杂合体优势
杂合子比纯合子有较高的适合度的情形。
31.
Recombination
重组
二
倍体生物中减数分裂期间同源(配对)染色体间的
DNA
交换。
32.
rRNA
核糖体
RNA
核糖体中的
RNA
< br>分子…………
33.
SNP
单核苷酸多态性
在
DNA
序列中一个特殊位点上出现不同核苷酸
碱基的等位基因。
34.
Sympatric speciation
同域发生(物种形成)
生活在同一地区的个体中形成的新物种。
35.
Vicariance
地理隔离
种群或物种被环境事件,如山脉形成造成的物理隔离
注:描黄部分为术语表中无相关解释的,仅供参考。
分子生态学简答题
1.
什么是分子生态学,
分子生态学的主要研究内容是什么?
教材的定义
:
分子生物学是应用分子生物学的原理和方法来研究
生命系统与
环境系统相互作用的生态机理及其分子机制的科学。
它是生态学与分子生物学相
互渗透而形成的一门新兴交叉学科。
研究内容:
包括种群在分子水平的遗传多样性及遗传结构,
p>
生物器官变异的
分子机制、
生物体内有机大
分子对环境因子变化的响应、
生物大分子结构、
功能
演变与环境长期变化的关系以及其它生命层次生态现象的分子机理等。
分子
生态
学的理论和方法对传统学科有巨大的促进作用,
同时,
p>
对解决诸如转基因、
克隆
技术应用中的生态
安全、环境与人类健康等重大问题将产生深刻的影响。
2.
什么是宏基因组学,其主要研究过程如何?
< br>宏基因组学(
Metagenomics
)又叫微生物环
境基因组学、元基因组学。它通
过直接从环境样品中提取全部微生物的
< br>DNA,
构建宏基因组文库,利用基因组学
的研究策略研
究环境样品所包含的全部微生物的遗传组成及其群落功能。
宏基因组学的研究过程:
对特定环境
中全部为生物的总
DNA
(也称宏基因组,
metagenomic
)进行克
隆,并通过构建宏基因组
文库和筛选等手段获得新的生理活性物质;或者根据
rDNA
数
据库设计引物,
通过系统学分析获得该环境中微生物的遗传多样性和分
< br>子生态学信息。
3.
什么是生态和进化基因组学,其主要研究内容如何?
研究环境条件与基因组结构、功能、动态及进化相互关系的学科。
4.
什么是亲缘地理学,其研究内容是什么?
研究调控系谱世系的地理分布的原理和过程的科学。
5.
什么是数量性状?数量性状有那些类型?
数量性状又称为适应性性状,
通常由互相影响的多个基因控制,
并会明显受
到环境的影响。在足够大的群体中,数量性状的分布基本符合正态规律。
数量性状的类型:连续型、阈值型、间断型(或离散型)
p>
连续型:
数量性状的表现为连续分布,
群体
中个体数足够多时,
连续型数量
性状基本符合正态分布,如:身
高、体重、奶牛产奶量等。
阈值型数量性状:
此种数量性状的表现会受到潜在风险因素的影响,
具有最
低或最高阈值,例如:生物的性成熟年龄,疾病的易感率等。
间断型数量性状:
只能用离散的数值或数组表示其表现型的数量性状,
如动
物每胎产仔个数、果蝇足上的刚毛数等。
6.
影响种群等位基因频率变化的进化过程有哪些?
种群进化的主要动力有:突变、遗传漂变、选择、基因的迁移(基因流动)
。
突变:
生物核酸序列上碱基种类或数
目发生改变,
导致新等位基因产生或原
有等位基因丧失。
遗传漂变:
由于进行有性生殖的生物的配子
形成过程具有随机性,
亲代的部
分遗传信息在通过配子传递给子
代时会由于这种不确定性而丢失,
导致部分等位
基因在整个种群
的下一代中频率降低甚至消失。
遗传漂变现象在小种群中表现尤
其明显。
选择:
外部自然环境对种群
等位基因的选择往往是定向的,
若等位基因所控
制的形状不能使
生物较好地适应生存环境,自然选择就会逐步淘汰这些等位基
因。
基因流动:
种群内个体在不同种群之间进行迁移时,
会造成不同种群之间等
位基因的混合。
整体而
言,
大规模的种群之间个体迁移能够调和等位基因频率分
布的不
均衡现象,有利于提高种群等位基因多样性。
7.
什么叫选择扫荡?是如何产生的?
A
selective sweep is the reduction or elimination of
variation among the nucleotides
in
neighboring DNA of a mutation as the result of
recent and strong positive natural
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