-
煮沸法快速提取质粒以及
DNA
酶解
和琼脂糖电泳
【实验目的】
【实验原理】
【材料试剂】
【操作步骤】
【注意事项】
【思考题】
【选择实验】
一.
实验目的:
1
、
掌握质粒
DNA
分离,纯化的原理
2
、
学习煮沸法快速提取质粒
DNA
的方法
3
、
学习
DNA
的限制性酶切的基本技术
4
、
学习利用琼脂糖电泳测定
DNA
片段的长度
二、
实验原理
在基因工程中,
DNA
分子的切割是由限制性内切酶来完成的。限制性内切酶能识别特定的
DNA
序列,
在一定的条件下切断双链
DNA
。限制性内切酶的作用效率是受多方面因素影响的,如
反应温度,缓冲体
系,离子种类与浓度,
DNA
的纯度和甲基化程度等。对
DNA
进行酶切时,首先要选择适合的缓冲液。
对于单酶切,应选用该酶的最适缓冲液;对于双酶切或三酶切,应选用一种能使所有酶都充分作用的缓
冲
液。
DNA
的纯度对于酶切的效果的影响也很大,因为蛋白质。酚。氯仿。
SDS
等杂质都会抑制限制性
内切酶的活性。
琼脂糖凝胶电泳是分离,
鉴定和纯化
DNA
片段的常规方法。利用低浓度的荧光嵌入染料
-
溴化乙锭进行
染色,可确定
DNA
在凝胶中的位置。如有必要,还可以从凝胶中
回收
DNA
条带,用于各种克隆操作。
琼脂糖凝胶的分辨能力要比聚丙烯酰胺凝胶低,但其分离范
围较广。用各种浓度的琼脂糖凝胶可以分离长
度为
200bp
至近
50kbp
的
DNA
。长度
100kb
或更大的
DNA
,可以通过电场方向呈周期性变化的脉
冲电场凝胶电泳进行分离。
在基因工程的常规操作中,琼脂糖凝胶电泳应用最为广泛。它通常采用水平电泳装置,在强度和方向恒定
的电场下进行电泳。
DNA
分子在凝胶缓冲液(一般为碱性)中带负电荷,在电场中由负极向正极迁移。
DNA
分子迁移的速率受分子大小,构象。电场强度和方向,
碱基组成,温度和嵌入染料等因素的影响。
三
.
实验材料和试剂:
1
.
菌种:
含
pUC18
的大肠杆菌
JM107
菌株。
2
.
化学试剂和溶液
(
1
)
LB
培养基:
NaCl 10g/l
酵母提取物
5g/l
胰蛋白胨
10g/l
氨苄青霉素
50 μ g/ml
(培养基灭菌后加入)
pH7.0
(
2
)
70%
乙醇(
-20
℃)及无水乙醇(
-20
℃)
(
3
)
STET
缓冲液(
pH8.0
)(
8%
蔗糖,
0.5%Triton, 50mmol/L EDTA,,10mmol/L
Tris
)
(
4
)
5%CTAB
(十六烷基三甲基溴化氨)
(
5
)
1.2M
氯化钠
(
6
)
TE
缓冲液(
10mmol/L Tris-HCl, 1mmol/L EDTA
)
(
7
)
电泳缓冲液(
50XTAE
)
Tris 242g
,
冰醋酸
57.1ml
,
EDTA(0.5mol/LpH8.0) 100ml
使用时用蒸馏水稀释
50
倍。
(
8
)
样品缓冲液(
6X
)
0.25%
溴酚蓝,
0.25%
二甲苯青,
40%
(
W/V
)蔗糖
(
9
)
溴化乙锭
10mg/ml
(
10
)
琼脂糖(电泳级)
(
11
)
限制性内切酶
(
12
)
溶菌酶(
50mg/ml
,溶于
10mmol/L
Tris-HCl
,
pH 8.0
)
3.
仪器设备
:
台式离心机、超净工作台、高压灭菌锅、恒温振荡培养箱、恒
温水浴箱等。
Eppendorf
离心管,
Tip
头,三角瓶等灭菌备用。
电泳仪,
电泳槽,
样品梳,
微波炉,
水浴锅,
移液器
(
20ul, 200ul
和
1000ul
)
,
离心管,
Tips(200ul,1000ul)
。
四
.
操作步骤:
1.
质粒提取
(
1
)
将
2ml
含相应抗生素的
LB
培养基加入到容量为
15ml
p>
的试管中,接种一单菌落,用棉塞封口,
在
37
℃剧烈震荡(
250rpm
)培养过夜。
(
2
)
将
1.5ml
培养物转入离心管中,用台式离心机在
4
℃条件下离心
30
秒(
12,000 ×
g
)。
(
3
)
p>
弃上清液,用滤纸吸干离心管中的液体培养基,将细菌沉淀物悬浮于
200 m l STET
缓冲液,用涡旋
混合器充分混匀。