邢昭林上大学吗-我被外甥操
1
算法和模型的相通性
?
算法是为了解决 一个特定问题而需要执行
的一系列步骤或指令。
?
模型是为了研究一个特定系统，通过抽象
和简化而建立的代表这个系统的一种模式。<
/p>
～～都需要输入数据，且都能够输出数据。
算法是根据输入数据得出输出数据
——
问题的
解。
模型是根据输入数据得出输出数据，从而反映
其
所代表系统的特性。
2
Why
use
Unix
？
?
稳定性好
:
Over
25
years
in
industry
and
academia.
?
?
开放性好：
Suppor ting
possible
tasks
in
future.
Internet
上的操作系统：
< p>Thesoftware
that
powers
the
Web
was
invented
in
Unix,
and
many
if
not
most
web
servers
runs
on
Unix
servers.
科学软件的载体：
Many
good-quality,
interesting and
important scientific software
are
written for Unix.
共享的乐园：
Many
programs
can
be
downloaded
and
installed
on
Unix
systems
for free.
更加具有同一性。
?
一方面，用蛋白质序列进行序列比对的灵
敏度高于用
D NA
序列进行序列比对的灵敏
度，从而有利于寻找和联系亲缘关系较远<
/p>
的序列；
?
另一方面，仅仅进行蛋白质序列比对可 能
丢失与进化过程直接有关的一些信息。
5 cDNA
文库
?
提取出组织细胞的全部
mRNA
，在体外反转录
成
cDNA
，与适当的载体（如噬 菌体或质粒载
体）连接后转化受体菌，则每个细菌含有一段
cD
NA
，并能繁殖扩增，这样包含着细胞全部
mRNA
信息 的
cDNA
克隆集合称为该组织细胞的
cDNA
文库。
?
一个
cDNA
文库中的某 两个克隆，可能来源于
同一种
mRNA
，也可能不是；可 能是全长，但
一般不是全长。
高
中
资
料
试
卷
调
整
试
验
；
通
电
检
< br>查
所
有
设
备
高
中
资
料
试
卷
电
相
力
互
保
作
护
用
装
与
置
相
通
调
< br>互
试
关
过
技
系
管
术
，
线
，
根
不
电
据
仅
力
生
保
产
护
工
可
高
艺
< br>以
中
高
解
资
中
决
料
资
吊
试
料
顶
卷
试
层
配
卷
配
置
要
置
技
求
不
< br>术
，
规
是
对
范
指
电
高
机
气
中
组
设
资
在
备
料
进
进
试
行
行
卷
继
< br>空
问
电
载
题
保
与
护
带
，
高
负
而
中
荷
且
资
下
可
料
高
保
试
中
障
< br>卷
资
总
料
体
试
各
配
卷
类
置
调
管
时
控
路
，
试
习
需
验
题
要
；
到
< br>在
对
位
最
设
。
大
备
在
限
进
管
度
行
路
内
调
敷
来
整
设
确
使
过
保
< br>其
程
机
在
组
正
中
高
常
，
中
工
要
资
况
加
料
下
强
试
与
看
卷
过
安
< br>度
全
工
，
作
护
并
下
关
且
都
于
尽
可
管
可
以
路
能
正
高
地
常
中
缩
< br>工
资
小
作
料
故
；
试
障
对
卷
高
于
连
中
继
接
资
电
管
料
保
口
试
护
< br>处
卷
进
理
破
行
高
坏
整
中
范
核
资
围
对
料
，
定
试
或
值
卷
者
，
弯
< br>对
审
扁
某
核
度
些
与
固
异
校
定
常
对
盒
高
图
位
中
纸
置
资
，
料
编
< br>保
试
写
护
卷
复
层
工
杂
防
况
设
腐
进
备
跨
行
与
接
自
装
地
动
置
线
< br>处
高
弯
理
中
曲
，
资
半
尤
料
径
其
试
标
要
卷
避
调
等
免
试
，
错
方
< br>要
误
案
求
高
，
技
中
编
术
资
写
交
料
重
底
、
试
要
。
电
卷
设
管
气
< br>保
备
线
、
设
护
高
敷
电
备
、
装
中
设
气
调
管
置
资
技
课
试
路
动
料
< br>术
件
高
敷
作
试
中
中
中
设
，
卷
包
调
资
技
并
试
含
试
料
术
且
验
线
< br>试
拒
方
槽
卷
绝
案
、
技
动
以
管
术
作
及
架
，
系
等
来
统
多
避
启
项
< br>免
动
方
不
方
式
必
案
，
要
；
为
高
对
解
中
整
决
资
套
高
料
启
中
试
< br>动
语
卷
过
文
突
程
电
然
中
气
停
高
课
机
中
件
。
资
中
因
料
管
此
试
< br>壁
，
卷
薄
电
电
、
力
气
接
高
设
口
中
备
不
资
进
严
料
行
等
试
调
问
< br>卷
试
题
保
工
，
护
作
合
装
并
理
置
且
利
调
进
用
试
行
管
技
过
线
术
< br>关
敷
，
运
设
要
行
技
求
高
术
电
中
。
力
资
线
保
料
缆
护
试
敷
装
卷
< br>设
置
技
原
做
术
则
到
指
：
准
导
在
确
。
分
灵
对
线
活
于
盒
。
调
处
< br>对
试
，
于
过
当
差
程
不
动
中
同
保
高
电
护
中
压
装
资
回
置
料
路
高
< br>试
交
中
卷
叉
资
技
时
料
术
，
试
问
应
卷
题
采
调
，
用
试
作
金
技
为
< br>属
术
调
隔
是
试
板
指
人
进
发
员
行
电
，
隔
机
需
开
一
要
处
变
在
理
< br>压
事
；
器
前
同
组
掌
一
在
握
线
发
图
槽
生
纸
内
内
资
部
料
强
故
、
< br>电
障
设
回
时
备
路
，
制
须
需
造
同
要
厂
时
进
家
切
行
出
断
外
具
习
< br>部
高
题
电
中
电
源
资
源
高
料
，
中
试
线
资
卷
缆
料
试
敷
试
验
设
卷
< br>报
完
切
告
毕
除
与
，
从
相
要
而
关
进
采
技
行
用
术
检
高
资
查
中
料
< br>和
资
，
检
料
并
测
试
且
处
卷
了
理
主
解
。
要
现
备
高
中
资
料
试
卷
< br>布
置
情
况
与
有
关
高
中
资
料
试
卷
电
气
系
统
接
线
保
场
护
设
装
置
< br>。
等
情
况
，
然
后
根
据
规
范
与
规
程
规
定
，
制
定
设
备
调
试
高
中
< br>资
料
试
卷
方
案
。
?
?
Linux
?
Linux is a free, open source version of Unix.
?
Linux
can
turn
an
ordinary
PC
into
a
powerful
workstation.
Under
Linux,
inexpensive
PCs
regarded
as
“obsolete”
by
Windows
user
become
startlingly
flexible and useful
workstations.
?
Linux is an excellent platform for developing
software.
3
计算机语言
编程灵活度上：
（越灵活越容易编，但越易出错）
Perl > Java
C
>
C++
执行效率上：
C > C++ > Java > Perl
4 DNA
序列比对与蛋白质 序列比对
由于遗传密码的简并性，蛋白质序列比
DNA
序 列
6
获得
cDNA
全长的步骤
（
1
）获得全长
cDNA
序列及其 信息（
1
）
?
获得序列：实验操作往往很 复杂，比如先
通过特殊的限制性方法构建全长
cDNA
文
库，再（根据已知的区段信息）筛选对应
此种
c DNA
的特定克隆；
?
获得序列信息：由于测序技术的限 制（一
次几百
bp
）
，一般很难直接测出 全长序列，
所以可能需要打断，测序，再拼接片段信
息。
（
2
）获得全长
cDNA
序列及 其信息（
2
）
?
获得序列信息：通过构建 普通的
cDNA
文
库，进行高通量自动测序，我们可以得
到
大量的序列片断信息。运用序列自动拼接
软件工具，拼接这些
片断信息，可以同时
推测多种全长
cDNA
序列信息。< /p>
?
获得序列：之后可以根据全长信息在实验
室中获
得实际序列（如设计
“
全长
”
引物，
PCR
筛选普通
cDNA
文库）
。
（
3
）
cDNA
克隆单次测序产生一个
EST
通过自动测序仪
对一个
cDNA
克隆单次测序很难产
生整个克隆序列信息
，往往只能产生一个片断序列
信息，称为一个
EST
。也 可以说，应用自动测序仪
对一个
cDNA
克隆的一种
“
读法
”
产生一个
EST
。
这种读法可以从
5‘
端进行 ，也可以从
3’
端进行。
对
全<
/p>
部
高
中
资
料
试
卷
电
气
设
备
，
在
安
装
过
程
中
以
及
安
装
结
束
后<
/p>
进
行
1
（
4
）从
cDNA
文库测序产生 大量
EST
（
5
）用
ES T
拼接得到全长
cDNA
序列信息
运用序
列自动拼接工具，进行
EST
序列信息拼接，
可以同时获
得多种全长
cDNA
序列信息
7
EST
（
Expressed Sequence Tag
）的意义
?
它们是从
cDNA
测序产生的短序列信息，
根据两端有重叠序列的
EST
可以组装获得
全长的
cDNA
序列信息；
?
它们代表在特定组织或发育阶段表达的基
因，其相关分析是一种发现新基因和定位
基因的有效方法。
?
EST
分析
尽管
EST
< p>本身是不完整的甚至可能是不精
确的
DNA
序列，但
EST
分析将为确定全长
cDNA
、寻找 新基因和定位基因提供有价值
的线索
8
ES T
的特性
?
EST
序列中除了
< p>A、
G
、
T
、
C
外，可能出现
模糊碱基（如未知碱基
N
）
；
?
EST
序列可能出现错误
,
其中插入或缺失将
导致翻译时读码框移位（
fr ame-shifts
）
；
错误率：
genome 1/10kb
，
EST 1/100.
?
在数据库中，
EST
数据 可能是高度冗余的
—
—
交叉覆盖，甚至一个
EST
序列可能是另
一个
EST
序列的 一个片断。
9
基因组信息的三个层次
?
染色体基因 组，或简称基因组，即生物
体内所有细胞中的遗传信息。－
>DNA
。
?
表达基因组，或称转录基因组，即细胞某
个特定生长阶段中基因组的表达部分。
－
>mRNA
< p>。
?
蛋白质组，反映细胞特性和功能的所有蛋
白质分子。
－
>
蛋白质。
10
序列分歧度
---
（
sequence
divergence
）
K
是一种
相异性指数。
?
DNA
序列分歧度：
设两个
DNA
序列的碱基差异值为
N< /p>
，序列长度
为
L
，则差异率
P
＝
N/L
，
分歧度
——
K
＝
-?
ln(1- 4P/3)
?
蛋白质序列分歧度：
要 考虑其密码子基础，区分同义变化（
K
S
）和<
/p>
2
非同义变化（
K
A
）
。
11
最大似然法（
maximum likelihood method
< p>）
（
1
）评估所选定的进化树能够产生实际观察到的
数据的可能性：（基于置换）
（
2
）针对一个位点的进化，先把某种组合的核苷
酸置于进化树的内部结
点，根据取代函数计算每一
段进化的可能性，将所有段的这种可能性相加，得
到此进化树以此组合为进化途径产生此位点数据的
可能性；
（
3
）换组合，再算。将所有组合的这种可能性相
乘，得到此进化树产生此位点数据的可能性；
（
4
）换 位点，再算。将所有位点的这种可能性相
加，得到此进化树产生此（序列组）数据的可能
性
（似然值）
。
（
5
< p>）换进化树，再评估。具有最大似然值（产生
此数据可能性最大）的进化树被认为是
最可能的实
际进化树。
12
构建系统树的各种方 法之比较
1
）假设
?
UPGMA
：各分支置换速率一致；序列较短
时易造成较大错误。
?
邻接法：依赖于距离系数的准确性；序列
短时
，易有较大误差。
?
最大简约法：无明显假设；当序列间的分
< p>歧度较大时，效果好，反之效果差。
?
最大似然法：对进化 速率和核苷酸置换型
式的假设十分明确，但对违背假设的情形
不
敏感（
Robust
）
。
2
）计算时间
对
全
部
< br>高
中
资
料
试
卷
电
气
设
备
，
在
安
装
过
程
中
以
及
安
装
结
束
后
进
< br>行
高
中
资
料
试
卷
调
整
试
验
；
通
电
检
查
所
有
设
备
高
中
资
料
试
< br>卷
电
相
力
互
保
作
护
用
装
与
置
相
通
调
互
试
关
过
技
系
管
术
，
线
< br>，
根
不
电
据
仅
力
生
保
产
护
工
可
高
艺
以
中
高
解
资
中
决
料
资
吊
< br>试
料
顶
卷
试
层
配
卷
配
置
要
置
技
求
不
术
，
规
是
对
范
指
电
高
机
< br>气
中
组
设
资
在
备
料
进
进
试
行
行
卷
继
空
问
电
载
题
保
与
护
带
，
< br>高
负
而
中
荷
且
资
下
可
料
高
保
试
中
障
卷
资
总
料
体
试
各
配
卷
类
< br>置
调
管
时
控
路
，
试
习
需
验
题
要
；
到
在
对
位
最
设
。
大
备
在
限
< br>进
管
度
行
路
内
调
敷
来
整
设
确
使
过
保
其
程
机
在
组
正
中
高
常
，
< br>中
工
要
资
况
加
料
下
强
试
与
看
卷
过
安
度
全
工
，
作
护
并
下
关
且
< br>都
于
尽
可
管
可
以
路
能
正
高
地
常
中
缩
工
资
小
作
料
故
；
试
障
对
< br>卷
高
于
连
中
继
接
资
电
管
料
保
口
试
护
处
卷
进
理
破
行
高
坏
整
中
< br>范
核
资
围
对
料
，
定
试
或
值
卷
者
，
弯
对
审
扁
某
核
度
些
与
固
异
< br>校
定
常
对
盒
高
图
位
中
纸
置
资
，
料
编
保
试
写
护
卷
复
层
工
杂
防
< br>况
设
腐
进
备
跨
行
与
接
自
装
地
动
置
线
处
高
弯
理
中
曲
，
资
半
尤
< br>料
径
其
试
标
要
卷
避
调
等
免
试
，
错
方
要
误
案
求
高
，
技
中
编
术
< br>资
写
交
料
重
底
、
试
要
。
电
卷
设
管
气
保
备
线
、
设
护
高
敷
电
备
< br>、
装
中
设
气
调
管
置
资
技
课
试
路
动
料
术
件
高
敷
作
试
中
中
中
设
< br>，
卷
包
调
资
技
并
试
含
试
料
术
且
验
线
试
拒
方
槽
卷
绝
案
、
技
动
< br>以
管
术
作
及
架
，
系
等
来
统
多
避
启
项
免
动
方
不
方
式
必
案
，
要
< br>；
为
高
对
解
中
整
决
资
套
高
料
启
中
试
动
语
卷
过
文
突
程
电
然
中
< br>气
停
高
课
机
中
件
。
资
中
因
料
管
此
试
壁
，
卷
薄
电
电
、
力
气
接
< br>高
设
口
中
备
不
资
进
严
料
行
等
试
调
问
卷
试
题
保
工
，
护
作
合
装
< br>并
理
置
且
利
调
进
用
试
行
管
技
过
线
术
关
敷
，
运
设
要
行
技
求
高
< br>术
电
中
。
力
资
线
保
料
缆
护
试
敷
装
卷
设
置
技
原
做
术
则
到
指
：
< br>准
导
在
确
。
分
灵
对
线
活
于
盒
。
调
处
对
试
，
于
过
当
差
程
不
动
< br>中
同
保
高
电
护
中
压
装
资
回
置
料
路
高
试
交
中
卷
叉
资
技
时
料
术
< br>，
试
问
应
卷
题
采
调
，
用
试
作
金
技
为
属
术
调
隔
是
试
板
指
人
进
< br>发
员
行
电
，
隔
机
需
开
一
要
处
变
在
理
压
事
；
器
前
同
组
掌
一
在
< br>握
线
发
图
槽
生
纸
内
内
资
部
料
强
故
、
电
障
设
回
时
备
路
，
制
须
< br>需
造
同
要
厂
时
进
家
切
行
出
断
外
具
习
部
高
题
电
中
电
源
资
源
高
< br>料
，
中
试
线
资
卷
缆
料
试
敷
试
验
设
卷
报
完
切
告
毕
除
与
，
从
相
< br>要
而
关
进
采
技
行
用
术
检
高
资
查
中
料
和
资
，
检
料
并
测
试
且
处
< br>卷
了
理
主
解
。
要
现
备
高
中
资
料
试
卷
布
置
情
况
与
有
关
高
中
资
< br>料
试
卷
电
气
系
统
接
线
保
场
护
设
装
置
。
等
情
况
，
然
后
根
据
规
< br>范
与
规
程
规
定
，
制
定
设
备
调
试
高
中
资
料
试
卷
方
案
。
<
<
<
3
）估计一致性（
Consistency
）
?
距离矩阵法
distance
matrix
met hod
：进化
速率恒定时一致；进化速率变化时不一致
< br>或难一致。
?
最大简约法
maximum parsimony method
：
不一致。
?
进化简约法：转换
/
颠换＝
1
时 一致；反之
不然。
距
进
最
最
13
基因组大小
生物基因组大小和基因数目并不绝对成比例。
生物基因组大小与进化位置并不绝对相关。
14
结构基因组分析
——
基因组作图
?
Cytogeneti c maps
?
Genetic linkage maps
?
STS maps
?
RH maps
?
Clone-based maps
15
蛋白质组分析
1
）分离
--
双向凝胶电泳（
2D
－
gels
）
第一向：等电聚焦（
IEF
）
，蛋白质沿
pH
梯度分
离，至各自的等电点；
第二向：
SDS
电泳，按分子量分离。
2
）
2D
－
gels
分析
< p>*
?
图像分析：斑点位置和密度分析（包括斑
点分离、背景消减等工作）
。
?
斑点配比：同种斑点的 识别（蛋白差异表
达分析的前提）
。
< br>?
聚类分析：蛋白质表达矩阵。
3)
鉴定方法：< /p>
片段离子搜索
fragment ion searching
从头测序
de novo sequencing
肽质指纹分析（
Peptide-mass fi ngerprinting
）
高
中
资
料
试
卷
< br>调
整
试
验
；
通
电
检
查
所
有
设
备
高
中
资
料
试
卷
电
相
力
互
保
作
< br>护
用
装
与
置
相
通
调
互
试
关
过
技
系
管
术
，
线
，
根
不
电
据
仅
力
< br>生
保
产
护
工
可
高
艺
以
中
高
解
资
中
决
料
资
吊
试
料
顶
卷
试
层
配
< br>卷
配
置
要
置
技
求
不
术
，
规
是
对
范
指
电
高
机
气
中
组
设
资
在
备
< br>料
进
进
试
行
行
卷
继
空
问
电
载
题
保
与
护
带
，
高
负
而
中
荷
且
资
< br>下
可
料
高
保
试
中
障
卷
资
总
料
体
试
各
配
卷
类
置
调
管
时
控
路
，
< br>试
习
需
验
题
要
；
到
在
对
位
最
设
。
大
备
在
限
进
管
度
行
路
内
调
< br>敷
来
整
设
确
使
过
保
其
程
机
在
组
正
中
高
常
，
中
工
要
资
况
加
料
< br>下
强
试
与
看
卷
过
安
度
全
工
，
作
护
并
下
关
且
都
于
尽
可
管
可
以
< br>路
能
正
高
地
常
中
缩
工
资
小
作
料
故
；
试
障
对
卷
高
于
连
中
继
接
< br>资
电
管
料
保
口
试
护
处
卷
进
理
破
行
高
坏
整
中
范
核
资
围
对
料
，
< br>定
试
或
值
卷
者
，
弯
对
审
扁
某
核
度
些
与
固
异
校
定
常
对
盒
高
图
< br>位
中
纸
置
资
，
料
编
保
试
写
护
卷
复
层
工
杂
防
况
设
腐
进
备
跨
行
< br>与
接
自
装
地
动
置
线
处
高
弯
理
中
曲
，
资
半
尤
料
径
其
试
标
要
卷
< br>避
调
等
免
试
，
错
方
要
误
案
求
高
，
技
中
编
术
资
写
交
料
重
底
、
< br>试
要
。
电
卷
设
管
气
保
备
线
、
设
护
高
敷
电
备
、
装
中
设
气
调
管
< br>置
资
技
课
试
路
动
料
术
件
高
敷
作
试
中
中
中
设
，
卷
包
调
资
技
并
< br>试
含
试
料
术
且
验
线
试
拒
方
槽
卷
绝
案
、
技
动
以
管
术
作
及
架
，
< br>系
等
来
统
多
避
启
项
免
动
方
不
方
式
必
案
，
要
；
为
高
对
解
中
整
< br>决
资
套
高
料
启
中
试
动
语
卷
过
文
突
程
电
然
中
气
停
高
课
机
中
件
< br>。
资
中
因
料
管
此
试
壁
，
卷
薄
电
电
、
力
气
接
高
设
口
中
备
不
资
< br>进
严
料
行
等
试
调
问
卷
试
题
保
工
，
护
作
合
装
并
理
置
且
利
调
进
< br>用
试
行
管
技
过
线
术
关
敷
，
运
设
要
行
技
求
高
术
电
中
。
力
资
线
< br>保
料
缆
护
试
敷
装
卷
设
置
技
原
做
术
则
到
指
：
准
导
在
确
。
分
灵
< br>对
线
活
于
盒
。
调
处
对
试
，
于
过
当
差
程
不
动
中
同
保
高
电
护
中
< br>压
装
资
回
置
料
路
高
试
交
中
卷
叉
资
技
时
料
术
，
试
问
应
卷
题
采
< br>调
，
用
试
作
金
技
为
属
术
调
隔
是
试
板
指
人
进
发
员
行
电
，
隔
机
< br>需
开
一
要
处
变
在
理
压
事
；
器
前
同
组
掌
一
在
握
线
发
图
槽
生
纸
< br>内
内
资
部
料
强
故
、
电
障
设
回
时
备
路
，
制
须
需
造
同
要
厂
时
进
< br>家
切
行
出
断
外
具
习
部
高
题
电
中
电
源
资
源
高
料
，
中
试
线
资
卷
< br>缆
料
试
敷
试
验
设
卷
报
完
切
告
毕
除
与
，
从
相
要
而
关
进
采
技
行
< br>用
术
检
高
资
查
中
料
和
资
，
检
料
并
测
试
且
处
卷
了
理
主
解
。
要
< br>现
备
高
中
资
料
试
卷
布
置
情
况
与
有
关
高
中
资
料
试
卷
电
气
系
统
< br>接
线
保
场
护
设
装
置
。
等
情
况
?
最大似然法：一致性取决于建立似然函数
的进化模型。
4
）符合程度评价
(1)
计算机模拟：模拟进化，用以 评价构树方法的符
合程度。
A.
< p>进化速率恒定时：最大简约法≤邻接法≈最小
进化法；最大似然法依赖于进化模型。
B.
进化速率可变时：最大简约法≤邻接法＜最大< /p>
似然法；
但当
转换
/
颠换
远大于
1
时，邻接法＞
最大似然法。
(2)
实际进化：预先得到了实际的进化树（如实验室
控制进化）
，再来 检验分子构树的各种方法。克服
了计算机模拟中参数选定的主观性。
5
）一般构树方法选用策略
序列间有极高相似性：最大简约法。
序列间有较明显的相似性：距离矩阵法。
序列间没有较明显的相似性
：最大似然法。
肽质指纹分析原理
酶解拟鉴定蛋白质，测定实际
肽段质谱图；
从蛋白质数据库中随机挑选一段蛋白质序列，理论
酶解之，并计算出各个肽段的分子量，从而构建出
理论质谱图；
将实际肽段质谱图与此蛋白序列的理论质谱图进行
比较，进行相似性计分；
从数据库中重新挑选一段序列，重复以上两步；
最后，根据相似性计分从数据
库中寻找最可能的蛋
白序列。
4
）蛋白质组分的 自动化鉴定
高流通量筛选（
High throughout screening, HTS
）：
机器人自动处理
——
转移双向凝胶图至
PVDF
膜、切割分离蛋白质组
分；
1.
控制酶解、传输至液相色谱分离、传输至质
谱测肽段质量；
2.
控制氨基酸组分分析；
自动搜索数据库进行蛋白质组分的鉴定。
?
1000
个蛋白质。
ExPASy--
综合性蛋白质信息服务器
16
生物信息学软件
?
学术途径：用于学术研究的软件一般可 以
免费或低费用获得。
——
自由软件
?
商业途径：商业开发的软件需支付相当的
费用，以获得产品和相应
服务。
——
商业
软件
自由软件的
特点
获得：免费或低费用，作者愿意共享。英特网是获
得自由软件的有效途径：有些可以直接通过浏览器
访问运行（如
Blast
，
Clustal
，
CAP3
等）
；有些要
下载（如
Phyl ip
）
，甚至在本地机器上编译。
使用
：一般是作为专门用途的单独程序或一组程序。
需要相当的熟练过程：用户必须熟悉输入
/
输出数
据的格式，学会有效地运行这些程序。尤其是进
行
多个程序的分析较为麻烦。
商业软件的特点
获得：一般价格比较昂贵，特别是作为多用户用途
的那些种类。
以光碟或网上付费的形式提供产品以
及相应的使用指南和升级服务。
使用：通常以集成功能的软件包形式开发。一般都
提供运行程序的友好环境，利于不
同功能的程序之
间的相互调用或顺序运作。
对
< br>全
部
高
中
资
料
试
卷
电
气
设
备
，
在
安
装
过
程
中
以
及
安
装
结
束
< br>后
进
行
3
，
然
后
根
据
规
范
与
规
程
规
定
，
制
定
设
备
调
试
高
中
< br>资
料
试
卷
方
案
。
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