广东出省读大学-小学三年级英语试卷分析
武汉大学
2007
—
2008
学年 度
高校教师研修班
《生物信息学》试卷（
B
）及答案
一、
翻译下列名词并解释。
(
每题
5
分，共
25
分
)
1. HGP
2. SRS
3. Markov Chain
4. ANN
5. CDS
二、填空
每空
2
分，共
20
分
)
1
、生物信息学主要研究的两种信息载体是
和
。
2
、目前国际上主要的核酸数据库是由
建立和维护
的
、
由
维
护的
，和
日
本遗
传
研究
所
建立
和
维
护
的
。
每个机构负责收集来自不同地理分布的数据，
3
个数据库
所有信
息并向世界开放，
3
、
在进行序列两两比对时，有两方面问题直接影响相似性分值：
和
。
三
、解释说明：请按要求对下列
GenBank
文件作解释说明。
(
每小题
4
分，共
20
分
< p>)
1
、
LOCUS
行中的第
3
项
mRNA linear
表示
，这里是
。
< br>2
、
DEFINITION
行在
GenBa nk
记录中用以
3
ACCESSION
是
，是从数据库中检索一个记录的主要
。
4.
FEATURES
后面部分是
，直接表达了记录的生物背景知识，
5 CDS
30
…
533
表示
。
四、问答。
（共
35
分）
1
、
DNA
测序有哪些方法？其基本原理 是什么？（
10
分）
2
、简述蛋白质结构预测的基本思想和方法。
（
10
分）
< p>
3
、试述人类基因组计划与生物信息学的关系。
（
15
分）
《生物信息学》试卷（
B
）答案
一、
翻译下列名词并解释。
(
每题
5
分，共
25
分
)
1. HGP Human genome
project
人类基因组计划
2. SRS
Sequence Retrieval System
序列检索系统
3.
马尔科夫链（
Markov Chain
）
，对于生物分子序列分析，马尔科夫链是一个很好的数学统
计模
型，因为马尔科夫链本身就是相继发生事件的序列，其特征是对于事件序列中的任何一
个
事件都有一个发生概率，而这个概率依赖于该事件之前的若干个事件。
4. ANN Artificial Neural Network,
人工神经网络
5. CDS
指的是编 码序列
,
从起始密码子到终止密码子
二、填空
(
每空
2
分，共
20
分
)
1
、生物信息 学主要研究的两种信息载体是
DNA
分子和蛋白质分子
2
、目前国际上主要的核酸数据库是由美国国立生物技术信息中心建立和维护的< /p>
Genbank
库、
由欧洲生物信息学研究所
(EBI)
维护的
EMBL-Bank
，和日本遗传研究所建立 和维护的日本
DNA
数据仓库
(DDBJ)
。
每个机构负责收集来自不同地理分布的数据，
3
个数据库共同享有所有信
息并向世界开放，
3
、
在进行序列两两比对时，有两方面 问题直接影响相似性分值：取代矩阵和空位罚分。
< br>三、解释说明：请按要求对下列
GenBank
文件作解释说明。
(
每小题
4
分，共
20
分< /p>
)
1
、
LOC US
行中的第
3
项
mRNA linear
表示生物分子的类型，这里是单链的
mRNA
。
2
、
DEFINITION
行在
GenBank
记录中用以总结记录的生物意义
3
ACCESSION
是检索号，是从数据库中检索一个记录的主要关键词。
4.
FEATURES
后面部分是特性表，直接表达了记录的生物背景知识，
5 CDS 30
…
533
表示编 码序列是从序列的第
30
个核苷酸到第
533
个核 苷酸的连续序列
四、问答。
（共
35
分）
1
．
DNA
测序有哪些方法？其基本原理 是什么？（
10
分）
答：
①链终止法测序
.
基本原理
:
通 过合成与单链
DNA
互补的多核苷酸链
,
由于合成 的互补链
可在不同位置随机终止反应
,
产生只差一个核苷 酸的
DNA
分子
,
从而来读取待测
DNA
分子的顺
序
.
②
Maxam Gilbert DNA
化学降解法，基 本原理
:
在选定的核苷酸碱基中引入化学集团
,
再 用化
合物处理
,
使
DNA
分子在被修饰的位置降解
.